Experimente der zweifachen Varianzanalyse haben zwei unabhängige Faktoren, wobei jeder Faktor zwei oder mehr Stufen hat. Die zweifache ANOVA untersucht die Daten auf signifikante Unterschiede zwischen den Stufen eines Faktors und auf Wechselwirkungen zwischen den Faktoren.
Sie enthält auch einige der Basiselemente der DOE (Design of Experiments = Statistische Versuchsplanung), die ein wichtiges statistisches Werkzeug in der Datenanalyse ist. Zusätzlich zur zweifachen Varianzanalyse beinhaltet das Dialogfeld ANOVATwo-Way in Origin verschiedene Methoden für Mittelwertvergleiche und zur Analyse der tatsächlichen und der hypothetischen Trennschärfe.
Das Dialogfeld ANOVATwo-Way benutzt einen linearen Regressionsansatz zur Berechnung der zweifachen Varianzanlyse und unterstützt deshalb auch Datensätze mit unterschiedlichen Stichprobenumfängen. Das ist wichtig, weil für Experimente nur selten die vollständige Kontrolle über den endgültigen Stichprobenumfang zu haben ist. Allerdings kann die zweifache ANOVA in Origin nicht mit leeren Zellen umgehen (d.h. mit Faktorstufen ohne Datenpunkte). Jeder der beiden Faktoren muss mindestens zwei Stufen haben und jede Faktorstufe muss mindestens einen Datenwert enthalten.
Um eine zweifache ANOVA durchzuführen: